重庆市统计局设13个职能处（室）：
（一）办公室
综合协调和管理局机关文书档案、接待信访、保密、保卫、消防等行政工作；负责政务信息的传递与反馈以及文秘和督办工作；管理机关国有资产；负责本局计划生育和外事工作，以及有关职工生活等服务性工作。
（二）政策法规处
拟定地方统计法规、统计行政规章草案，提出有关修改意见，指导区县（自治县、市）统计行政规章的制订和修改；依法对各单位、组织和个体工商户进行统计登记；组织统计法律、法规的宣传贯彻和检查监督，负责对全市统计调查单位登记的组织指导；负责全市统计行政复议工作；负责全市社会调查活动的管理。
（三）财务基建处（审计室）
统一管理县及县以上政府统计部门的统计事业费，负责对统计系统财务工作的指导和审计、监督；统一管理统计系统的基本建设投资；负责局机关财务管理工作；拟定统计系统财务管理规章制度；监督管理直属单位的国有资产。
（四）国民经济综合统计处
对全市国民经济运行状况进行统计监测、分析和预测，并综合考核评价地区经济发展状况；考核评价三峡库区社会、经济环境发展状况。编写国民经济和社会发展情况公报和统计年鉴编印；统计核定、管理、公布、出版其他全市性的基本统计资料；定期举行统计新闻发布会；对统计数据的使用和提供进行管理、审查；组织、实施全国城市基本情况统计报表制度和区县（自治县、市）综合统计年报制度。
（五）统计设计管理处
拟定全市统计制度改革规划和方案；组织制定全市国民经济核算项目；制定本市统计标准；审定部门（行业）统计标准，审批各部门统计调查制度和调查方案。
（六）国民经济核算处
组织实施国民经济核算制度，承担国内生产总值，投入产出、资金流量、国际收支、资产负债和资源环境核算工作；编制经济循环帐户；提供国民经济核算资料及有关综合平衡状况的分析报告。
（七）计算机应用管理处
负责组织全市统计信息系统建设与管理工作，制定全市统计信息系统建设规划并组织实施；负责和指导全市统计报表数据处理与管理，建立全市统计数据库系统；负责组织全市统计系统的信息技术应用与技术开发工作，管理区县（自治县、市）自动化系统的业务工作；负责全市统计信息网络系统的运行、维护与管理；负责计算机数据的安全保密。
（八）工业交通统计处
组织实施工业、能源统计调查，收集、整理和提供有关的调查统计数据；综合整理和提供交通、邮电统计数据，对有关统计数据质量进行检查和评估；定期考核评价工业企业经济效益；组织指导有关专业统计基础工作，进行统计分析。
（九）农村经济统计处
组织实施农村社会经济统计调查，收集、整理和提供调查统计数据；组织指导全市农村社会经济统计基础工作；对有关数据质量进行检查和评估；进行统计分析。
（十）贸易外经统计处
组织实施批发零售贸易业、饮食业以及商品市场运行状况的统计调查，收集、整理和提供有关调查统计数据；负责综合整理与提供外贸、外资和旅游等统计数据；对有关数据质量进行检查和评估；定期考核评价商业企业综合经济效益；组织指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。
（十一）固定资产投资统计处
组织实施固定资产投资、房地产业、建筑业的统计调查，收集、整理和提供有关调查统计数据；综合整理和提供地质勘探、城市住宅和公用事业等统计数据；对有关统计数据质量进行检查和评估；定期考核评价建筑、房地产企业综合经济效益；组织指导有关统计基础工作，进行统计分析。
（十二）人口就业统计处(社会科技统计处)
组织实施人口就业统计调查，收集、整理和提供有关调查统计数据；实施人口普查、抽样调查；对人口及就业统计数字质量进行检查评估；对人口及就业发展趋势进行统计预测；收集、整理和提供科技发展、技术进步、科技含量及服务企业、行政事业单位的调查统计数据；定期对三峡库区进行社会、经济环境监测；收集、整理全市高新技术产业统计资料；定期评价监测全市高新技术产业发展水平和综合经济效益；进行统计分析。
（十三）人事教育处
拟定系统人事管理的规章制度，受国家统计局委托管理国家在我市的城调队、农调队和企业调查队的干部人事业务，组织管理全市统计专业技术职务评聘及资格考试，管理局机关和事业单位的机构编制和干部工作，负责局机关干部职工的教育培训工作、专业人员继续教育以及职工正规化理论培训。
市纪委、市监察局派驻纪检组和监察室
负责局机关和直属单位党的纪律检查工作和行政监察工作，查处违法、违纪案件，加强党风廉政建设。
机关党委
负责局机关和直属单位党的思想、组织、作风建设；领导机关工、青、妇工作。
 此外，重庆市统计局还有城市调查队、农村调查队和企业调查队三支调查队。